Organisasi Siswa Intra Sekolah (OSIS) adalah pusat kegiatan pembinaan kesiswaan di sekolah untuk pengembangan minat, bakat, serta potensi siswa yang bertugas untuk mengendalikan aktivitas siswa-siswi UPT SMP Negeri 1 Kesamben agar mencapai tujuan yang positif. Beranggotakan 32 siswa, 17 siswa dari kelas 8 dan 15 siswa dari kelas 7. Memiliki 8 pengurus harian, 8 seksi bidang dengan 1 koordinator dan 2 anggota.

Rapat rutin OSIS dilaksanakan setiap hari Kamis setelah kegiatan belajar mengajar. Tujuan didirikannya OSIS adalah untuk melatih siswa dalam berorganisasi dengan baik dan menjalankan kegiatan sekolah yang berhubungan dengan siswa.

Untuk OSIS SMP Negeri 1 Kesamben pada mas bhakti 2021/2022 mempunyai 8 sie dengan pembina masing-masing sbb,

1. Ketaqwaan Terhadap Tuhan Yang Maha Esa : Nuryasin Zaudin, S.Pd.I

2. Kehidupan Berbangsa dan Bernegara : Marsufi Ani Rahayu, S.Pd

3. Pendidikan Pendahuluan dan Bela Negara : D.H. Kusumaningtyas, S.Pd

4. Kepribadian dan Budi Pekerti Luhur : Winarno, S.Pd

5. Berorganisasi Pendidikan Politik dan Kepemimpinan : Aris Teguh Wiyono, M.Ag

6. Keterampilan dan Kewirausahaan : Ananingsih, S.Pd

7. Kesegaran Jasmani dan Daya Kreasi : Riadi, S.Pd

8. Persepsi Apreasi dan Kreasi Seni : Wasis Suharto, S.Sn